Dès 1996, dans le cadre du Plan de déplacements urbains (PDU), la réalisation d'un Pôle d'Echanges Multimodal (PEM) en gare de La Roche-sur-Yon était préconisé. Un réaménagement complet du site avec réhabilitation des bâtiments actuels, de nouvelles aires de stationnement pour les voitures, les taxis, les bus..., la réalisation de parkings sécurisés pour les vélos, la création d'aménagements piétons et l'installation d'une gare routière commerciale à proximité de la gare SNCF font alors l'objet d'études, tendant à renforcer encore l'attractivité de la ville chef-lieu du département.

Dans le même temps, la ville de La Roche-sur-Yon mène un projet ambitieux de remise à niveau de son centre historique napoléonien : c'est le projet « Pentagone 2020 » qui très vite, identifie trois pôles fonctionnels : la dimension culturelle dans l'ancienne gendarmerie, l'aspect commercial sur l'îlot Poste et le pôle d'échanges multimodal à la gare. Les différents partenaires du PEM - Etat, Région des Pays de la Loire, Département de la Vendée, Communauté de Communes du Pays Yonnais, Ville de La Roche sur Yon, SNCF et RFF - valident en novembre 2006 l'intégration d'une dimension urbanistique au PEM, ouvrant ainsi de nouvelles perspectives au quartier gare en particulier en y intégrant une offre de services et des aménagements ambitieux côté ouest notamment sur le boulevard Leclerc.
Un quartier qui connaît de grandes mutations depuis quelques années déjà avec l'ouverture de la nouvelle gendarmerie, l'installation de la direction départementale de l'agriculture et de la forêt, la suppression du passage à niveau de Forges, le départ annoncé du fret et de la Sernam... et l'arrivée du TGV en gare de La Roche-sur-Yon en décembre 2008.

Cette ouverture à l'ouest est renforcée encore par la construction d'une nouvelle liaison douce inter-quartiers; une nouvelle passerelle conçue par les architectes de renommée internationale, Bernard Tchumi et Hugh Dutton, a été imaugurée en février 2010. Le vieillissement de l'ancienne structure édifiée en 1904 par les Chemins de fer de l'Etat, son incapacité à supporter les mises aux normes nécessaires à l'électrification des voies, l'impossibilité pour les personnes à mobilité réduite d'utiliser l'ouvrage, ont en effet conduit le comité de pilotage du PEM à décider de son remplacement.


Concernant la gare routière, le programme a été approuvé par le conseil municipal du 29 mai 2008. il comprend environ 95 places de stationnement public liées au PEM, 130 places de stationnement privé liées aux futurs bureaux et résidences, une gare routière comportant 9 quais avec accès sur le boulevard Louis-Blanc, un lien piétons direct et accessible avec le parvis de la gare SNCF, 6 000 m² de bureaux et 4 000 m² de résidences services. Ce programme sous maîtrise d'ouvrage Ville est estimé à 5 205 000 € HT.